У регіоні Калос існувала давня казка про двох легендарних покемонів, Зеніаса та Івельтола, які, за переказами, з'являлися кожні 1000 років, щоб битися один з одним. Міф став реальністю, коли одного дня вони з'явилися у Ванівіль Тауні і занурили в хаос все навколо.

Після того, як їхні домівки були зруйновані, Екс, талановитий у битвах, який усамітнився після інциденту, пов'язаного з папараці, був змушений вирушити в подорож зі своїми друзями дитинства: Вай, ученицею-скайтренеркою, Тревором, майбутнім вченим, Т'єрно, експертом з танців, і Шоною, яка прагнула стати грумеркою для Фурфроу. Під постійною загрозою з боку лихої Команди Флейр, яка полює за таємничим Мега кільцем Екса, п'ятеро молодих тренерів повинні триматися разом і покладатися один на одного, щоб витримати всі випробування і знайти те, що вони шукають, включно з відповіддю на загадку Мега Еволюції...